Azatioprina tem sido amplamente utilizado como terapia de fundo em vários processos auto-imunes na natureza. Em 10% dos pacientes foram acompanhados por efeitos colaterais graves, difíceis de prever como mielossupressão, exigindo a retirada da medicação. Sua eficácia imunossupressora está relacionada ao suo rápido metabolismo in vivo a 6-mercaptopurina (6-MP), por La que están competindo basicamente três enzimas: xantina oxidase(XO), tiopurina metil transferase (TPMT) e hipoxantina fosforibosil transferase(HPRT). Atividade TPMT pode ser medido em eritrócitos. Variações no nível de atividade TPMT é devido à presença de diferentes alelos do gene TPMT. Esta variante genética é o fator responsável pela existência de diferenças individuais na ocorrência de toxicidade e efeitos terapêuticos. Pacientes com deficiência deTPMT acumulam uma maior concentração de metabólitos da 6-tioguanina e toxicidade, por tanto, maior a azatioprina. É identificado três subgrupos: pessoas homozigotos com alta atividade enzimática (TPMTHH), heterozigotos intermediária (TPMTLH) e homozigotos para o alelo de baixa atividade das enzimas (TPMTLL). Localização cromossômica: 6p22.3, herança autossômica recessiva.