Os coccídios que infectam o homem incluem a Isospora (Cystoisospora) belli, a Cyclospora cayetanensis, o Sarcocystis hominis e o Sarcocystis suihominis. Esses protozoários, no entanto, devem ser pesquisados em três amostras, pois um único resultado negativo não exclui o diagnóstico. - A Isospora pode causar diarreia em imunocompetentes, mas costuma ser mais grave em imunodeprimidos, nos quais o quadro diarreico usualmente se torna crônico e frequentemente se acompanha de eosinofilia. Já os sintomas provocados em imunocompetentes pela contaminação com a C. cayetanensis em geral se alternam com ciclos de diarreia e anorexia e ciclos de aparente remissão. - A infecção por Sarcocystis sp. está relacionada com o consumo de carne malcozida. As manifestações, que incluem náusea, dor abdominal e diarréia, ocorrem em cerca de três a seis horas após a ingestão do alimento contaminado. Em todos os casos, o diagnóstico é obtido com o exame microscópico das fezes após concentração por centrifugação e coloração de Kinyoun. - O Cryptosporidium spp., apesar de ser anteriormente considerado um coccídio, é atualmente classificado como gregarino. Oito espécies já foram descritas em humanos, sendo as mais frequentes o C. hominis e o C. parvum. A infecção incide mais em crianças de até 5 anos de idade e em imunodeprimidos, tendo também a diarreia como a principal queixa clínica. Nos pacientes sem comprometimento imunológico, usualmente há evolução para cura espontânea em até duas semanas. Uma vez que os portadores desse protozoário eliminam um número reduzido de cistos, a sensibilidade de um único exame pode ser tão baixa quanto 53%.