O HHV-6 é muito comum e é o agente causador do exantema súbito na infância. Em algumas crianças o quadro de infecção pode ser mais severo com meningite e hepatite. Depois da infecção primária o vírus permanece quiescente no indivíduo. Em indivíduos imunossuprimidos, principalmente em transplantados de medula, o vírus pode voltar a replicar levando a um quadro grave de pneumonite, meningite ou encenfalite. A detecção de HHV-6 em sangue total não significa que esteja ocorrendo replicação viral pois este vírus pode permanecer quiescente nos linfócitos. Já a presença do vírus no plasma e no líquor é sugestivo de replicação viral. O resultado Não Detectado não descarta a possibilidade do paciente apresentar o vírus, mas que a quantidade de DNA viral está abaixo do limite de detecção do ensaio.